Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A3Q14050 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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