Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms