Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOFQ13790 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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