Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDH18Q13634 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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