Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms