Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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