Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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