Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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