Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms