Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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