Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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