Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms