Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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