Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms