Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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