Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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KCNMA1Q12791 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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KCNMA1Q12791 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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KCNMA1Q12791 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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KCNMA1Q12791 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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