Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms