Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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