Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms