Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms