Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC010809.2-201ENST00000560404 964 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TTTY14-201ENST00000324446 1495 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CSRP3-202ENST00000533783 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms