Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms