Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms