Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2BQ00403 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms