Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA4P83105 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms