Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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