Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms