Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCBP4P57723 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms