Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBASH3AP57075 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms