Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2BFSP57053 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms