Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME5P56597 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms