Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BGRP55822 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BGRP55822 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms