Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms