Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TTPAP49638 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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