Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK8P49336 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms