Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC11A1P49279 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms