Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A3P48751 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms