Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms