Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZEB1P37275 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms