Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKBRP32239 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKBRP32239 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms