Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms