Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms