Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms