Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms