Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNNI3P19429 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms