Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELFEP18615 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELFEP18615 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NELFEP18615 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NELFEP18615 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NELFEP18615 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NELFEP18615 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NELFEP18615 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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