Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PRG2P13727 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRG2P13727 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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