Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BMP3P12645 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP3P12645 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms