Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms