Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHGAP10645 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms